Công trình nêu trên thuộc Dự án bảo tồn, tôn tạo và phát huy giá trị di tích lịch sử và khảo cổ Gò Tháp (xã Tân Kiều, huyện Tháp Mười) được khởi công từ tháng 12-2014, do Ban Quản lý Khu di tích Gò Tháp, thuộc Sở Văn hóa, Thể thao và Du lịch tỉnh Ðồng Tháp làm chủ đầu tư. Thời điểm đó, ông Nguyễn Hữu Lý giữ chức vụ Giám đốc Ban Quản lý Khu di tích Gò Tháp. Công ty Ánh Dương (trụ sở tại TP Hồ Chí Minh) trúng thầu thi công với tổng giá trị hơn 7,3 tỷ đồng.
Theo hợp đồng, công trình sẽ hoàn thành đưa vào sử dụng tháng 11-2015. Thế nhưng sau gần bốn năm, công trình vẫn ngổn ngang. Từ cuối năm 2018, UBND tỉnh Ðồng Tháp đã chỉ đạo Thanh tra tỉnh thanh tra toàn diện công trình này, qua đó phát hiện nhiều sai phạm của chủ đầu tư và đơn vị thi công.
Hiện, Phòng An ninh điều tra, Công an tỉnh Ðồng Tháp đang tiếp tục điều tra các sai phạm tại công trình tu bổ Miếu thờ Bà Chúa Xứ. Liên quan vụ việc, ngành chức năng đã khởi tố bị can, bắt tạm giam bốn tháng đối với Nguyễn Hoài Dương (52 tuổi, ngụ quận 5, TP Hồ Chí Minh), Giám đốc Công ty Ánh Dương, để điều tra.